Invertir siempre es una de las mayores incertidumbres de los tomadores de decisiones al implementar acciones de Eco eficiencia debido a que esto demanda grandes cantidades de recursos (dinero, tiempo y gente), lo cual no muchas veces se tiene disponible en la empresa y por lo tanto se ve en la necesidad de solicitarlo lo que acarrea el solicitar más dinero y por lo tanto comprometer el flujo de efectivo, además de lo anterior el retorno de inversión en la mayoría de las veces no es muy tangible y surgen muchas dudas de su efectividad, y esto aunado a que los resultados de las acciones de Eco eficiencia son de mediano y largo plazo aumentan las dudas de la inversión.
Para lograr cambios que la organización necesita (adaptación de los procesos productivos, capacitación del personal a los nuevos procedimientos operativos, compra de tecnologías más eficientes, etc.) es necesario tiempo y esfuerzo por parte de la organización y sus colaboradores.
Los beneficios de las acciones de Eco eficiencia deben ser contemplados en un periodo de tiempo amplio (mínimo 2 años) y siempre considerando que esta inversión está enfocada a la disminución de los costos de la organización (ahorro de agua, ahorro de energía y/o el consumo de materias primas).
